Випускник медичного факультету Медичної Академії в Любліні.
Пройшла спеціалізацію в Клініці загальної офтальмології SPSK № 1 у Любліні, як результат отримала звання спеціаліста з офтальмології в 2015 році. З 2015 року працює в Клініці хірургії сітківки та склоподібного тіла SPSK No. 1 у Любліні. У 2018 році отримала звання доктора медичних наук з відзнакою, захистивши дисертацію на тему: «Оцінка хірургічно індукованого астигматизму в техніці бімануальної хірургії катаракти».
Стипендіат Європейського товариства катарактальних та рефракційних хірургів (ESCRS), Європейського товариства офтальмології (SOE) та Європейської ради офтальмології (EBO). Вона пройшла стажування за кордоном у галузі діагностики захворювань сітківки (в ESASO Лугано та Бонні), а також у хірургії переднього сегмента та вітреоретинальній хірургії в Равенні, IMO – у Барселоні, VISSUM – у Аліканте, FOM – у Валенсії та ESASO – в Лугано.
У повсякденній амбулаторній практиці займається діагностикою, моніторингом та лікуванням захворювань переднього і заднього відділу ока, передусім, катаракти, дегенерації жовтої плями та діабетичної ретинопатії. В офтальмологічному відділенні одноденної хірургії виконує операції з видалення катаракти, лазерну корекцію зору та імплантацію факічних лінз ICL.
Також пані Агата Прокоп’юк є фахівцем з лікування ВМД; проводить інтравітреальні ін’єкції анти-VEGF препаратів; лазерне лікування в передньому сегменті (включаючи капсулотомію та іридотомію) та задньому сегменті (панфотокоагуляція, лазерне барражне та мікроімпульсне лазерне лікування). Також займається кваліфікацією з хірургії катаракти, вітректомії, інтравітреальних ін’єкцій, лазерного лікування, проводить ОКТ та ангіо-ОКТ макули, ОКТ зорового нерва, УЗД очного яблука та корекцію дефектів зору дітей та дорослих.
Є автором та співавтором конгресових доповідей, публікацій та розділів наукових монографій. Постійно бере участь у тренінгах та конференціях, поглиблює знання та підвищує фахову професійну кваліфікацію.